Kuidas toimub Terviseameti nakkushaiguste laboris ahvirõugete proovide testimine?

Inimene läheb perearsti juurde, kaebab sügelevate punnide üle. Arst vaatab, et on nagu tuulerõuged, aga äkki on ahvirõuged. Mis edasi saab? Kes võtab proovi ja kuidas see jõuab Terviseameti nakkushaiguste laborisse?

WHO poolt on ette antud juhised, mida tuleb proovi võtmisel järgida. Ahvirõugete sümptomid on sarnased rõugetele, kuid leebemas variandis - haigestumise algusfaasil esineb palavik, tugev peavalu, lihasvalu, seljavalu, lümfisõlmede turse ja väsimus. Iseloomulik nahalööve tekib 1-3 päeva pärast palaviku teket. Esialgu näitab praktika, et perearstid kipuvad tuulerõugete tunnuseid segi ajama ahvirõugete omadega. Üldjuhul põevad täiskasvanud tuulerõugeid raskemini võrreldes lastega ning senised juhtumid ongi peamiselt olnud tuulerõuged. Koos nakkushaiguste osakonnaga sai aegsasti koostatud juhised, millele lisasime labori poolt juhendi nii proovide võtmise kui ka laborisse saatmise jaoks. Nakkuse kahtluse korral kannab patsiendilt proovide võtmise eest hoolt kas pereõde või haiglas vastav proovivõtja. Kasutatakse väga kindlat proovivõtutarvikut, mis on juhistes täpselt kirjeldatud ning juurde on lisatud selle foto.

Niisiis võetakse perearsti juures või haiglas proov ja saadetakse Terviseameti laborisse. Mida selle prooviga laboris tehakse?

See on tegelikult tavaline teise bio-ohuklassi analüüs, mille käigus eraldatakse nukleiinhape ehk DNA. Ja edasi segatakse kokku PCR (polümeraasi ahelreaktsioon ehk viiruse DNA koopiaid sünteesitakse suures korduses) reaktsioonisegu ning teostatakse reaalaja-PCR (RT-PCR). Kogu protseduur kestab kokku kuni vastuse väljastamiseni 3 tundi.

Mida labori tellitud RT-PCR reagentide komplekt sisaldab ja mitut proovi saab ühe komplektiga testida?

See sõltub kitist. Kui on kommertsiaalsed kitid, siis seal on tavaliselt kõik see info olemas. Meil on testimiskomplekt, millest saab teha viiskümmend testi analüüsi. See sisaldab puhvrit PCR-reaktsiooni tegemiseks, samuti praimereid, mis võimaldavad spetsiifilist sihtmärk-regiooni viiruse DNA-st kopeerida PCR-i käigus ja ensüümi, mis teostab sünteesireaktsiooni. Reagentide komplektis sisalduvad veel fluorestseeruvad molekulid, tänu millele on võimalik RT-PCR reaktsiooni tulemust reaalajas jälgida – kas on moodustumas positiivne signaal või mitte. Kui proovis on olemas näiteks ahvirõugeid põhjustava viiruse DNA, siis see signaal seal fluorestseerub ja ongi näha ning kui ei ole näha, siis signaali ei ole.

Laboris eelistame kasutada juba valmis reagentide komplekti ehk kit-i, mis on valmis kasutamiseks ning siis ei ole vaja laboris meetodi juurutamiseks läbi viia töö- ning ressursimahukat reaktsiooni optimeerimist ning järgnevat valideerimist.

Kõik vajalikud vedelikud on seal sees juba olemas?

Täpselt! Ja sellega on kaasas ka täpsed meetodi juhised ning meie lihtsalt avame karbi ja paneme segu kokku. See sisaldab ka kõiki vajalikke kontrolle. Selles sisaldub näiteks täiendav kontroll, mis amplifitseerib väikest regiooni inimgenoomist. Et kui see inimgeeni signaal on positiivne, siis me teame, et reaktsioonis sisaldub kindlasti inimeselt võetud proovi materjal.

Nii et kui keegi saadab proovi, mis sisaldab õunamahla, siis sealt inimgenoomi ei tuvasta?

Sealt ei saa, jah, positiivset vastust.

Nii. Aga kui te olete nüüd ahvirõugete testimisel kõik oma protseduurid ära teinud, siis ilmub vastus arvutiekraanile?

Jah - seadme tarkvara annab visualiseeritud tulemused. Samamoodi toimub koroonaviiruse määramine, nii et see on päris sarnane, kuid kui koroonaviirus on RNA-põhine viirus, siis ahvirõugete viirus on DNA-põhine viirus.

Kas labori töökorraldus on selline, et kui saabub ahvirõugete kahtlusega proov, siis pikka järjekorda ees ei ole ja saame juba kolme tunniga öelda, kas proov on positiivne või ei ole?

Jah. Kõik vajalik on korraldatud. Nakkushaiguste osakond on edastanud Eesti perearstidele juhised koos saatelehe vormiga. Samuti on kõik vajalik info avaldatud Terviseameti veebilehel. Täpselt sama info edastati ka haiglatele.

Vastasid Terviseamet nakkushaiguste labori juhataja Janne Pullat ja labori juhtivspetsialist Irina Eero.